Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp13a3Q5XF89 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms