Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bbs12Q5SUD9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms