Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms