Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lin28bQ45KJ6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lin28bQ45KJ6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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