Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ctdnep1Q3TP92 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms