Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hddc2Q3SXD3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc2Q3SXD3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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