Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Shroom4Q1W617 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Shroom4Q1W617 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shroom4Q1W617 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms