Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cers3Q1A3B0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cers3Q1A3B0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cers3Q1A3B0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cers3Q1A3B0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Cers3Q1A3B0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cers3Q1A3B0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms