Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms