Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms