Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf3Q07104 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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