Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms