Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms