Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnd1Q03719 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnd1Q03719 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms