Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxd1Q01822 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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