Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme2Q01768 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms