Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2bQ01097 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2bQ01097 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms