Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde1bQ01065 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms