Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms