Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms