Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CiitaP79621 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms