Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms