Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms