Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P58686 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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P58686 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P58686 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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