Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Setd4P58467 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Setd4P58467 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms