Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RabggtbP53612 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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