Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Map3k1P53349 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms