Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TspoP50637 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TspoP50637 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TspoP50637 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TspoP50637 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms