Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SftpdP50404 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SftpdP50404 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SftpdP50404 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpdP50404 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpdP50404 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SftpdP50404 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SftpdP50404 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms