Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Epb41P48193 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms