Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rpl28P41105 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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