Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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