Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RarbP22605 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms