Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms