Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RargP18911 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RargP18911 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RargP18911 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms