Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms