Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms