Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Amd1P0DMN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms