Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CcnkO88874 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms