Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3O54890 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms