Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptch2O35595 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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