Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Prrt1O35449 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Prrt1O35449 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Prrt1O35449 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Prrt1O35449 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Prrt1O35449 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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