Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcc1O35379 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcc1O35379 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcc1O35379 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcc1O35379 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcc1O35379 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcc1O35379 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcc1O35379 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcc1O35379 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcc1O35379 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms