Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ArxO35085 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ArxO35085 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms