Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MttpO08601 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms