Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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