Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930544D05RikJ3QK56 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms