Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pagr1bF6V0H0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms