Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms