Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim30bE9PVL6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms